Todas las almas

Mentalmente y físicamente enferma, la niña Dara Kernof pasa por el rito del bautismo. Esa misma noche, Dara, a pesar de su discapacidad, se levanta de la cama y sale a la calle bajo la lluvia. Luego se acerca a la figura oscura y se arrodilla. Su padre logra correr hacia su hija, pero luego la figura oscura brilla con una luz brillante, y Dara muere con las manos levantadas, como en la oración, y los ojos quemados.

Scully viene a la iglesia a confesar. Le dice al sacerdote que ha pecado. Todo el episodio se presenta como la historia de Scully a un sacerdote en un confesionario. Al mismo tiempo, varias veces los eventos regresan al confesionario, donde Scully habla sobre lo que sucedió y cómo la afectó. La historia comienza con el hecho de que Dana se dirige a un sacerdote familiar, el padre McCue. Le pide a Scully que ayude a la familia de la difunta Dara. Scully descubre que Dara era recepcionista, pero resulta incapaz de explicar cómo el discapacitado logró salir por su cuenta. El padre adoptivo de Dara describe una figura oscura que él mismo cree que es el Diablo. Con la ayuda de un patólogo local, Scully logra descubrir que la niña tenía 6 dedos, pero la causa de la muerte aún no está determinada: hay muy pocas quemaduras en el cuerpo para morir por un rayo. Scully pide ayuda a Fox Mulder.

Mientras tanto, el sacerdote Padre Gregory visita un hospital psiquiátrico para recoger a una niña llamada Paula Koklos, también mentalmente y físicamente enferma y también con seis dedos. Es detenido por el trabajador social Iron Starkey, quien afirma que se ha producido un error: la petición de Gregory de la custodia de la niña no ha recibido la confirmación del trabajador social. Esa misma noche, Paula muere al igual que Dara. Mulder descubre que Paula era la hermana de Dara, y que además de ellos hay dos hermanas más. Mulder también encuentra una Cruz invertida en la escena del crimen, que considera un símbolo de lucha contra la fe. Scully y Mulder visitan al padre de Gregory, quien dice que solo quería proteger a Paula. Cuando se le pregunta sobre la madre de Paula, Gregory responde evasivamente, mencionando solo que murió al nacer sus hijas. Mulder considera a Gregory culpable de los asesinatos, o al menos involucrado en ellos. Durante la autopsia del cuerpo de Paula, Scully descubre extraños tumores en las clavículas, similares a los rudimentos de las alas. Inesperadamente, Scully asiste a la visión de su difunta hija Emily, acostada sobre una mesa en el lugar del cuerpo de Paula.

Una tercera hermana se encuentra sin hogar, recientemente huyendo del centro de rehabilitación para adolescentes de Washington. Starkey ayuda a Mulder a encontrarla. Scully descubre que las hermanas tienen una enfermedad ósea progresiva. Mulder finalmente encuentra a su hermana en un edificio abandonado, pero es demasiado tarde: es asesinada de la misma manera extraña. En la escena del crimen, Mulder encuentra a Gregory, quien repite que "no tuvo tiempo de salvarla". En el interrogatorio, Gregory dice que el Diablo necesita llevarse las almas de las niñas, y él trata de poner esto. Cuando los agentes salen de la habitación, Starkey aparece allí y trata de averiguar el paradero de la Última hermana. Gregory comienza a orar y no dice nada. Entonces Starkey lo mata, haciendo que la piel del sacerdote se caliente mucho. Resulta que Starkey es el Diablo mismo.

Mulder descubre el paradero de la cuarta niña, Roberta Dyer. Él visita al cruel padre adoptivo de la niña, quien la adoptó solo por pagos sociales, pero allí no la encuentran. El padre dice que le dio a la niña a un sacerdote llamado Gregory. Mulder llama para decirle esto a Scully, y ella informa que Gregory está muerto. Durante la llamada, Scully deja caer las llaves y se inclina para levantarlas. En ese momento, ella nota alguna figura cerca de sí misma. Después de mirar la figura, Scully se queda sin palabras: los rayos de luz emanan del hombre y tiene cuatro caras. Por la mañana, Scully visita la iglesia para hablar sobre esta extraña visión. El padre McCue trae un libro que ilustra quién es el desconocido: ángel Serafín. Una vez vino a la Tierra con el objetivo de recuperar las almas de los cuatro Nephilim nacidos con almas angelicales, lo que hizo que sus cuerpos fueran desfigurados. En el libro, los Nephilim tienen 6 dedos. El padre considera una coincidencia cómo la historia del libro es similar a lo que está sucediendo en la realidad. Al salir de la iglesia, Scully recoge a Starkey, quien le informa que Mulder ha descubierto que la cuarta niña está en la iglesia. Allí, Scully se da cuenta de que la sombra de Starkey tiene cuernos, y él mismo no puede entrar a la iglesia. Scully logra encontrar a la niña, pero Starkey exige que Scully la traiga a él. En ese momento, una luz brillante se ilumina desde el pasillo, y Scully escucha una voz rezando para guiar a la niña hacia la luz. Scully va a la luz, pero luego se detiene y no quiere dejar ir a Robert: ella siente que Emily está en su lugar. Pero la niña suelta la mano de Scully y va a la luz. Después de eso, el Diablo y la luz desaparecen, y Roberta se encuentra muerta con los ojos quemados, Serafín salvó su alma.

El episodio termina con el razonamiento de Scully y el sacerdote en el confesionario. El sacerdote cree que Scully dejó ir a Robert porque creía que estaba dejando ir el alma de Emily al cielo. Scully está de acuerdo. El sacerdote dice que Scully todavía no sabe cómo reconciliarse con el hecho de su muerte y que también es una lección que debe aprender: aceptar la pérdida de su hija. Scully responde: "¿Tal vez esa es la fe?"