Все души

Душевно и физически больная девочка Дара Керноф проходит обряд крещения. В ту же ночь Дара, несмотря на инвалидность, встаёт с кровати и выходит на улицу в дождь. Затем она подходит к тёмной фигуре и встаёт на колени. Её отец успевает подбежать к дочери, но тут тёмная фигура вспыхивает ярким светом, а Дара погибает с поднятыми, как при молитве, руками и выжженными глазами.

Скалли приходит в церковь исповедаться. Она говорит священнику, что согрешила. Весь эпизод поставлен как рассказ Скалли священнику в исповедальне. При этом несколько раз события возвращаются в исповедальню, где Скалли рассуждает о произошедшем и о том, как это на неё повлияло. Начинается рассказ с того, что к Дане обращается знакомый священник – отец МакКью. Он просит Скалли помочь семье покойной Дары. Скалли выясняет, что Дара была приёмной, но оказывается не в состоянии объяснить, как инвалиду удалось выйти на улицу самостоятельно. Приёмный отец Дары описывает тёмную фигуру, которую он считает самим Дьяволом. При помощи местного патологоанатома Скалли удаётся выяснить, что у девочки было 6 пальцев, но причина смерти всё ещё не определена: для смерти от попадания молнии на теле слишком мало ожогов. Скалли обращается за помощью к Фоксу Малдеру.

Тем временем священник Отец Грегори посещает психиатрическую больницу, чтобы забрать девочку по имени Паула Коклос, тоже душевно и физически больную и тоже с шестью пальцами. Его останавливает социальный работник Айрон Старки, который заявляет, что произошла ошибка: прошение Грегори об опеке над девочкой не получило подтверждение от социального работника. В ту же ночь Паула умирает так же, как Дара. Малдер выясняет, что Паула была сестрой Дары, и что кроме них есть ещё две сестры. Также Малдер находит на месте преступления перевёрнутый крест, который считает символом борьбы против веры. Скалли и Малдер посещают отца Грегори, который говорит, что хотел лишь защитить Паулу. На вопрос о матери Паулы Грегори отвечает уклончиво, упомянув лишь то, что она умерла при рождении дочек. Малдер считает именно Грегори виновным в убийствах или, по крайней мере, причастным к ним. Во время вскрытия тела Паулы Скалли обнаруживает странные опухоли на ключицах, похожие на зачатки крыльев. Неожиданно Скалли посещает видение своей покойной дочери Эмили, лежащей на столе на месте тела Паулы.

Третья сестра оказывается бездомной, недавно сбежавшей из центра реабилитации подростков Вашингтона. Найти её Малдеру помогает Старки. Скалли выясняет, что у сестёр есть прогрессирующее костное заболевание. В итоге Малдер находит сестру в заброшенном здании, но слишком поздно: она оказывается убита тем же странным способом. На месте преступления Малдер находит Грегори, который повторяет, что "не успел спасти её". На допросе Грегори рассказывает, что Дьяволу нужно забрать души девочек, а он пытается этому помещать. Когда агенты покидают комнату, там появляется Старки и пытается выяснить местонахождение последней сестры. Грегори начинает молиться и ничего не говорит. Тогда Старки убивает его, заставив кожу священника сильно нагреться. Выясняется, что Старки – сам Дьявол.

Малдер выясняет местонахождение четвёртой девочки – Роберты Дайер. Он посещает жестокого приёмного отца девочки, который удочерил её только из-за социальных выплат, но там её не находят. Отец говорит, что отдал девочку священнику по имени Грегори. Малдер звонит сообщить это Скалли, а она сообщает, что Грегори мёртв. Во время звонка Скалли роняет ключи и наклоняется их поднять. В этот момент она замечает какую-то фигуру около себя. Посмотрев на фигуру, Скалли теряет дар речи: от человека исходят лучи света, и у него четыре лица. Утром Скалли посещает церковь, чтобы рассказать об этом странном видении. Отец МакКью приносит книгу, в которой проиллюстрировано, кем является неизвестный – ангелом Серафимом. Некогда он пришёл на Землю с целью забрать души четверых нефилим, рождённых с ангельскими душами, из-за чего их тела оказались обезображены. В книге у нефилим по 6 пальцев. Отец считает совпадением то, как история из книги похожа на происходящее в реальности. На выходе из церкви Скалли подбирает Старки, который сообщает ей, что Малдер выяснил: четвёртая девочка находится в церкви. Там Скалли замечает, что тень Старки имеет рога, а сам он не может зайти в церковь. Скалли удаётся найти девочку, но Старки требует, чтобы Скалли привела её к нему. В этот момент из коридора загорается яркий свет, и Скалли слышит голос, молящий вести девочку к свету. Скалли идёт к свету, но потом останавливается и не хочет отпускать Роберту: ей кажется, что на её месте находится Эмили. Но девочка сама отпускает руку Скалли и идёт на свет. После этого Дьявол и свет исчезают, а Роберта оказывается мёртвой с выгоревшими глазами – её душу спас Серафим.

Завершается эпизод рассуждениями Скалли и священника в исповедальне. Священник считает, что Скалли отпустила Роберту потому, что считала, что отпускает душу Эмили на небо. Скалли соглашается. Священник говорит, что Скалли всё ещё не знает, как примириться с фактом её смерти и что это тоже урок, который ей стоит усвоить – принять потерю дочери. Скалли отвечает: "Может быть, это и есть вера?"